Общий механизм репликации.
Точное самовоспроизведение ДНА возможно благодаря её особой структуре. Модель структуры ДНК была обнародована Ф.Криком и Д.Уотсоном в 1953 году. Согласно ей ДНК представляет собой длинную двухцепочечную полимерную молекулу. Мономерами являются нуклеотиды, соединённые в каждой цепи фосфодиэфирными связями. Сахарофосфатный остов молекулы, который состоит из фосфатных групп и дезоксирибозных остатков соединённых 5'-3'-фосфодиэфирными связями , образует как бы боковины винтовой лестницы, а пары оснований -её ступеньки. Две полинуклеотидные цепи навиты одна на одну, образуя двойную спираль. Вместе они удерживаются водородными связями , образующимися между комплиментарными основаниями противоположных цепей (между А и Т; G и C). Цепи молекул ДНК антипараллельны: одна из них имеет направление 5¢®3¢, другая 3¢®5¢. Последовательность мономерных единиц (дезоксирибонуклеотидов) в одной её цепи соответствует (комплиментарна) последовательности дезоксирибонуклеотидов в другой. Уотсон и Крик предположили, что для удвоения ДНК должны произойти разрыв водородных связей и расхождение цепей(рис.1) и что удвоение ДНК происходит путём последовательного соединения нуклеотидов на матрице материнской цепи в соответствии с правилом комплиментарности. В дальнейшем эта матричная природа механизма репликации была подтверждена многочисленными опытами. Подтверждение также получил предложенный полуконсервативный способ репликации двухцепочечной ДНК {Мезельсон, Сталь, 1958 (объект-E.coli); Тэйлор,1958( объект-Vicia faba)}.Согласно ему, в результате дупликации образуются две пары цепей, в каждой из которых только одна является родительской (консервативной), а вторая- заново синтезированной. Другие механизмы (консервативный, дисперсный) не подтвердились.
Ауторадиографический анализ, проведённый в начале 60-х гг. (Керренс,1963) на реплицирующихся хромосомах меченых 3Н-тимидином, показал наличие определённой зоны, где происходила репликация. Эта зона двигалась вдоль родительской двойной спирали. Из-за Y-образной структуры её назвали репликативной вилкой. Именно в ней и происходят основные процессы, обеспечивающие синтез ДНК. Вилки образуются в структуре, называемой репликативный пузырёк. Это области хромосомы, где две нити родительской спирали ДНК разъединяются и служат как матрицы для синтеза ДНК. Это место, где происходит инициация репликации, называется точкой начала репликации (точкой ori). Образование репликативных вилок происходит в двух направлениях (двунаправленная репликация) и их они затем движутся до встречи с другой вилкой или с концом матрицы. В некоторых случаях наблюдается движение только одной вилки, тогда как вторая является стационарной (однонаправленная репликация). У прокариот на нуклеоиде находится обычно только одна точка ori, тогда как у эукариот их много (например, у дрожжей порядка 500), расположенных на хромосоме на расстоянии 20-35 т.п.н. Участок между двумя точками ori получил название репликон. Скорость репликации у прокариот составляет порядка 1000-2000 нуклеотидов в секунду, у эукариот ниже из-за нуклеосомной организации хроматина (10-200 нуклеотидов в секунду). Скорость репликации всей молекулы ДНК (или хромосомы) зависит от числа и расположения точек ori.