Подсчет колоний.
Этот широко применяемый метод позволяет определять количество жизнеспособных клеток, образующих на плотной среде видимые колонии. На получаемые результаты может, однако, влиять изменение в состоянии клеток при инкубации в новых условиях и, кроме того, при использовании этого метода могут оказаться неучтенными покоящиеся формы бактерий. Как правило, перед посевом готовят серийные разведения культуры, например в физиологическом растворе, содержащем фосфатный буфер. Если культура густая, делают несколько 10- или 100-кратных разведений, поскольку количество жизнеспособных клеток
в пробе заранее не известно. Напротив, разбавленные пробы, например из природных водоемов, содержащие незначительное число бактерий, концентрируют фильтрованием или иногда центрифугированием. Посев производят поверхностным или глубинным способом.
При поверхностном посеве инокулят в виде суспензии клеток объемом 0,1 мл наносят на поверхность застывшей агаровой среды. При глубинном посеве вносят 0,1-1,0 мл инокулята в еще не застывшую среду, после чего ее перемешивают и разливают по чашкам Петри (предполагается, что кратковременное пребывание клеток в расплавленной агаровой среде, при 45 °С не влияет на их жизнеспособность, но это необходимо проверять). Анаэробные бактерии, для подсчета клеток выращивают во вращаемых пробирках: пробирки с небольшим количеством расплавленной агаризованной среды, закрытые пробками, вращают в горизонтальном положении на холоду, в результате чего агар застывает в виде тонкой пленки на стенках пробирки. Другой способ учета анаэробных бактерий —это посев в двухслойный агар;
бактерии высевают на агаризованную среду в чашках Петри и поверх нее наносят тонкий слой полужидкого агара. Развитие небольших, компактных колоний происходит под его поверхностью. Для анаэробов используют также посев в тонкий слой агара:
инокулят вносят в небольшое количество расплавленного и остуженного полужидкого агара (0,75%), который выливают затем в чашку Петри с плотной средой. Подсчет колоний производят обычно в тех чашках (или вращаемых пробирках), в которых содержится от 30 до 300 колоний. Для достоверности результатов необходимо подсчитать несколько сотен колоний. При статистической обработке данных определяют стандартное отклонение как квадратный корень числа подсчитанных колоний. Каждый из этих методов предполагает контроль эффективности посева
с помощью прямого подсчета числа клеток (см. ниже); эта эффективность должна быть близка к 100%. Кроме того, следует проверять, что клетки в инокуляте не образуют скоплений. Результаты количественного учета клеток
обычно выражают в колониеобразующих единицах.
Для определения численности бактерий в сильно разбавленных пробах (например, питьевой воде) рекомендуется использовать метод подсчета колоний на мембранных фильтрах.
Пробы фильтруют через мембранные фильтры с необходимыми размерами пор, после чего фильтр помещают на агаризованную среду или просто на фильтровальную бумагу, пропитанную питательной средой. Колонии образуются на поверхности фильтра благодаря проникновению через него питательных веществ из среды. Недостаток всех описанных методов состоит в том, что многие бактерии могут быть высокочувствительными к некоторым компонентам агара. Посев для подсчета колоний можно объединить с физиологическими тестами, используя индикаторный агар.